1. ToBRFV : le virus du fruit rugueux brun

Ce tobamovirus possède un génome constitué d'ARN. Il résiste relativement bien dans l'environnement et se transmet surtout par les contacts : mains, outils, tuteurs, vêtements et opérations culturales. Des semences contaminées peuvent introduire le virus dans un nouvel espace de culture.

Symptômes : mosaïques ou déformations sur le feuillage, marbrures jaunes et brunes, maturation irrégulière et parfois rugosité des fruits. Certains plants présentent peu de signes visibles.

Conséquences : l'Organisation européenne et méditerranéenne pour la protection des plantes (OEPP) rapporte des pertes de rendement de 30 à 70 % sur des plants atteints dans certains contextes. Jusqu'à 100 % des plants d'une culture peuvent être infectés, ce qui ne veut pas dire que 100 % des récoltes sont systématiquement perdues. Un exemple israélien mentionne seulement 8 à 10 bouquets récoltés au lieu de 24 à 30 auparavant. Source : OEPP.

Contrôle : depuis 2025, le ToBRFV figure parmi les ORNQ pour les semences et plants de tomate dans le cadre européen ; le seuil réglementaire indiqué pour les semences de tomate est de 0 %. Les exigences concrètes figurent dans les règlements applicables.

2. Chancre bactérien : Clavibacter michiganensis

Cette bactérie peut pénétrer par des blessures et coloniser le xylème, le réseau qui transporte l'eau dans la plante. Elle se diffuse aussi lors des manipulations et peut être introduite avec du matériel végétal contaminé.

Symptômes : flétrissement parfois limité à un côté de la plante, brunissement interne des tiges, chancres et lésions de fruits qui peuvent prendre l'aspect d'un petit point brun cerclé de blanc (« œil d'oiseau »).

Conséquences : dépérissement de pieds entiers et pertes commerciales. Un faible niveau de contamination initiale peut suffire à amorcer un foyer si les conditions favorisent les contaminations croisées. Le danger est aussi lié à l'existence de plantes infectées avant l'apparition de symptômes clairs.

Pour les semences, les textes européens prévoient notamment des conditions particulières sur les méthodes d'extraction et l'origine sanitaire ou le contrôle des lots.

3. Flétrissement bactérien : Ralstonia

Les bactéries du complexe Ralstonia solanacearum peuvent survivre dans certains milieux contaminés et pénétrer par les racines. En se multipliant dans le système vasculaire, elles perturbent la circulation de l'eau.

Symptômes : flétrissement rapide, parfois sans jaunissement initial, puis mort du plant ; les vaisseaux peuvent brunir.

Conséquences : destruction des plants infectés, contamination possible par l'eau d'irrigation et, en cas de foyer officiellement reconnu, mesures de lutte réglementaire pouvant concerner les végétaux, les parcelles ou l'eau. Des foyers sur tomate ont historiquement été détectés en France, notamment dans les années 1990.

Les formes et espèces de Ralstonia ne sont pas toutes interchangeables : le diagnostic en laboratoire et l'identification réglementaire sont essentiels.

4. Taches bactériennes : Xanthomonas spp.

Plusieurs bactéries du genre Xanthomonas provoquent une maladie du feuillage et des fruits. Elles sont favorisées par les conditions chaudes et humides et les éclaboussures d'eau.

Symptômes : petites lésions sombres sur les feuilles, jaunissement, défoliation et taches rugueuses sur les fruits.

Conséquences : baisse du rendement, fruits déclassés et risque accru de brûlures solaires lorsque le feuillage disparaît. Des études de foyers sévères font état de pertes dépassant 50 %, mais ces chiffres ne représentent pas la situation moyenne d'une culture de tomate.

5. PSTVd : un viroïde particulièrement discret

Un viroïde n'est pas un virus classique : c'est une très courte molécule d'ARN infectieuse, sans enveloppe protéique. Le PSTVd peut être transmis mécaniquement et, dans certaines circonstances, par des semences ou du pollen.

Symptômes : réduction de croissance, déformations foliaires, chloroses ou diminution de la production ; l'infection peut également rester peu visible.

Conséquences : plants affaiblis et difficultés de détection à l'observation seule. La gravité dépend du variant, de la variété et des conditions de culture ; il serait trompeur de lui attribuer un taux unique de pertes.

6. TSWV : la maladie bronzée de la tomate

Le TSWV est un virus transmis par des thrips, petits insectes piqueurs-suceurs. L'insecte acquiert habituellement le virus à l'état larvaire et peut ensuite le transmettre à d'autres plantes.

Symptômes : bronzage des feuilles, stries nécrotiques, flétrissement et anneaux marbrés sur les fruits.

Conséquences : récoltes déclassées et, en cas d'infection précoce et sévère, développement très réduit voire mort de certains plants. La gestion des insectes vecteurs est centrale.

7. TYLCV : les feuilles jaunes en cuillère

Ce virus à ADN se transmet essentiellement par l'aleurode Bemisia tabaci. Il provoque un dérèglement de la croissance du plant.

Symptômes : feuilles petites, jaunissantes, recourbées vers le haut, entre-nœuds courts et arrêt de croissance.

Conséquences : si l'infection intervient très tôt, la fructification peut devenir très faible ou quasi nulle. Une infection tardive est souvent moins dommageable pour les fruits déjà formés.

8. PepMV : la mosaïque du pépino

Le PepMV est un virus à ARN transmis particulièrement facilement par les gestes de culture et par contact entre végétaux. Les semences constituent une voie possible d'introduction.

Symptômes : marbrures du feuillage, feuilles déformées, fruits présentant des plages jaunes ou orangées et une maturation irrégulière.

Conséquences : qualité commerciale diminuée ; les pertes varient fortement selon les souches virales, les variétés et les conditions. Certaines infections restent discrètes.